Wuhan Coronavirus (Osa 1)

Rushimato · Maaliskuu 21, 2020, 6.43pm

Toivon todella paljon että tuo auttaisi, ja toivon että siitä tulee randomized controlled trial dataa pian ulos. Syyt miksi olen kriittinen sen paperin evidenssistä lääkkeen tehoon on koska sen analyysissä ei:
a) vakioida taustamuuttujia esim: ikä, tupakointihistoria, taustalla olevat perussairaudet jne.
b) tutkimusta ei ole randomisoitu, vaan control-ryhmänä on käytetty tutkimuksesta kieltäytyneitä, jotka yleensä ovat huonommassa kunnossa ja vähemmän koulutettuja kuin tutkimukseen osallistuvat verrokkinsa

Tutkimuksen puolesta tosin puhuu aiempi kiinalainen vastaava study, jossa on saatu vastaavia tuloksia. Tässä tilanteessa uskon että saamme nopeasti hyvät tulokset RCT:stä koska ainakin tutkimuksia on aiheesta monta käynnissä ja potilaita riittää maailmalla.

Bellemoron · Maaliskuu 21, 2020, 6.44pm

timontti · Maaliskuu 21, 2020, 6.57pm

No nyt

In_Der_Esche · Maaliskuu 21, 2020, 7.09pm

Itsensä lainaaminen on kuin koira nuolisi pallejaan, mutta menkööt tämän kerran.

The Telegraphin artikkeli nostaa esiin asian, joka koskee kuolemansyiden tilastointia Italiassa. Ei niin triviaalia kuin voisi kuulla.

But Prof Ricciardi added that Italy’s death rate may also appear high because of how doctors record fatalities.
“The way in which we code deaths in our country is very generous in the sense that all the people who die in hospitals with the coronavirus are deemed to be dying of the coronavirus.”

Tarkemmassa tarkastelussa suora koronakuolleisuus laski merkittävästi.

On re-evaluation by the National Institute of Health, only 12 per cent of death certificates have shown a direct causality from coronavirus, while 88 per cent of patients who have died have at least one pre-morbidity - many had two or three,” he says.

Mutkat suoriksi - kaikki koronatartunnan saaneet kuolleet eivät kuole koronatartuntaan. Vaikuttaa osaltaan, mutta ei ole tämän tiedon perusteella primäärisyy niin usein kuin tilastot antavat ymmärtää.

Tuo ei kuolleita lohduta, mutta auttaa minua ymmärtämään entistä paremmin sitä, kuinka sekalaista edessämme oleva tilastodata on. Ja ottakaa valmiiksi kriittinen asenne, kun otsikko kiljuu kuinka potilas X kuoli koronavirukseen.

Ihminen · Maaliskuu 21, 2020, 7.13pm

On tullut katsottua aika monta käsienpesuopastusta, mutta tämä on kaikista havainnollisin siitä, miksi kunnollinen sairaalakäsienpesu on aika eri asia kuin normaali maatiaispesu.

OldFeki · Maaliskuu 21, 2020, 7.27pm

Tuo on varmasti ihan totta. Tästä oli aiemminkin jo keskustelua ja keskustelua on myös ollut esim. influenssakuolleisuudesta, missä problematiikka on samanlainen.

Ehkä se maalaisjärjen mukainen tapa kirjata kuolinsyy monisairailla on kuitenkin aika lähellä Italian mallia. Jos elintoimintojen heikkeneminen sairaanhoitoa vaativaan tilaan ja myöhemmin kuolema on aiheutunut Koronavirustartunnasta, tilastoidaan kuolema Koronaviruksen aiheuttamaksi, vaikka yhtä suuri syypää tai varsinainen syy on vaikka sydänsairaus tai diabetes. Koronaviruksen taudinkuvasta on kerrottu sen verran, että sisäelinten kuolemaan johtavat toimintahäiriöt voivat olla moninaisia.

Onhan nuo vähän hankalia. Kysymys voisi kuulua: Olisiko tämä ihminen kuollut tässä ja tänään ilman Koronavirustartuntaa? Kyllähän yli 80-vuotiaan ihmisen kuolinsyy on lähes aina vanhuus, mikä pitää sisällään kirjon erilaisia vaivoja ja sairauksia…

Billions · Maaliskuu 21, 2020, 7.41pm

Italy : in the city of Bergamo, there were 108 more deaths in the first 15 days of March this year compared to 2019 (164 deaths in 2020 vs. 56 deaths in 2019) according to the mayor of the city Giorgio Gori. During this period, 31 deaths were attributed to the coronavirus ( less than 30% of the additional deaths this year )

" There are significant numbers of people who have died but whose death hasn’t been attributed to the coronavirus because they died at home or in a nursing home and so they weren’t swabbed ," said the mayor [source]

Jos ymmärsin oikein, tämä taas viittaisi siihen, että koronakuolemia alitilastoidaan.

In_Der_Esche · Maaliskuu 21, 2020, 7.46pm

Kyllä, itsekin linkitin Tilastokeskuksen aiheeseen liittyvän raportin. Ehkä viittasitkin siihen.

Enkä kritisoi italialaisia lääkäreitä - heillä on taatusti kiire ja on helpompi kategorisesti niputtaa koronatartunnan saanut ja kuollut potilas koronakuolleeksi. Koska on kiire seuraavan avuksi.

Maiden välisen vertailun tilastoinnin epäselvyys tekee kuitenkin hyvin hankalaksi. Itsekin sorruin pitämään edes kuolleiden määrää suht pitävänä vertailulukuna. Ihmettelyni esim. Saksan ja italian koronakuolleiden erojen välillä lopetan, koska tilastointikriteerien ilmeiset erot tekevät sen hedelmättömäksi.

Fiksuinta olisi raportoida koronan saaneet kuolleet potilaat viikossa ja vertailulukuna esimerkiksi kaikkien kuolleiden määrän muutos/viikko aiempien vuosien keskiarvoon. (Tai voi käyttää pidempää, juoksevaa aikasarjaa.) Toki näiden tekeminen on hankalampaa.

OldFeki · Maaliskuu 21, 2020, 7.58pm

Tuosta Saksan tilanteesta olisi kieltämättä hyvä saada lisätietoa tässä valossa. Vielä ehkä vaikea uskoa, että kysymys olisi vain tilastoinnista, kun Koronan kaltaisen vakavan taudin takia sairaalaan on jouduttu. Ehkä Saksan sairastuneiden ikäjakauma on hieman erilainen, kuin Italiassa. Tiedä tuota.

Luin pari kuukautta sitten, että Suomessa influenssan kanssa on samaa ongelmaa ja osa lääkäreistä ei pidä kuolleisuuslukuja oikeina. Osa Suomen lääkäreistä mieltää ilmeisesti Influenssan kuolinsyyksi elimiston immuniteetin heikkenemisen johdosta aiheutuneisiin tauteihin esim. Pneumokokin aiheuttamat verenmyrkytys jne. Yleensähän nuo mielletään omiksi jälkitaudeikseen ja sellaisina ne jäävät myös tilastoihin.

Mutta joo. Väärä kuva voi syntyä helposti epäyhtenäisillä tilastointitavoilla.

Bellemoron · Maaliskuu 21, 2020, 8.34pm

Ohessa mielestäni sellainen hyvin havainnollistettu ja pelkistetty video koronaviruksesta, joka jokaisen kansalaisen olisi hyvä katsoa.

ihmesaataja · Maaliskuu 21, 2020, 10.02pm

vain puoletko;)

jps · Maaliskuu 22, 2020, 4.23am

Tuo kuolleiden määrän lisääntyminen on käytännössä varmasti Coronasta johtuvaa, mutta vaikeampaa on määritellä on yksittäinen kuolema siitä johtuva. Pandemia on ajanut Italiassa ja erityisesti Bergamossa sairaanhoidon tarpeen yli kaikkien käytössä olevien resurssien, pulaa on tiloista, henkilökunnasta, tarvikkeista ja lääkkeistä, siis kaikesta normaalista hoidon ketjuun liittyvästä.

Tuo sairaanhoidon kriisi aiheuttaa sitten ketjuuntumisilmiötä seurauksissa. Kun Coronavirus jyllää ja sairastuttaa ihmisiä, niin ei se juurikaan vähennä muita sairauksia, joita olisi normaalitilanteessakin. Ihmiset saavat sydäreitä, sairastavat syöpää, ovat tapaturmissa ja niin edelleen. Reurssipula lisännee kuolemia näidenkin osalta, koska heitäkään ei ole mahdollista hoitaa samalla tasolla kuin aiemmin. Tällöin kuolinsyy ei ole Corona, vaikka kuolema johtuu Coronan aiheuttamasta kapasiteettivajeesta.

Passi · Maaliskuu 22, 2020, 4.34am

Pieni toivonkipinä Kiinasta: ensimmäisen rokotteen kliininen tutkimus aloitettu torstaina.

108 ihmistä mukana tutkimuksessa
Tähän mennessä mietoja sivuvaikutuksia
Rokotteen on kehittänyt CanSino Biologics (listattu Honkkarissa) yhdessä Kiinan armeijan kanssa
Aikaisempien raporttien mukaan koe kestää kuusi kuukautta
Australialaisen professorin mukaan rokotteen voisi saada markkinalle 6-9 kuukautta kliinisen tutkimuksen aloittamisen jälkeen

OldFeki · Maaliskuu 22, 2020, 5.24am

Aamun luvut (tartunnat/kuolleet): 310531 / 13173

Italiassa todettiin vuorokauden aikana yli 6500 uutta tartuntaa. Se on yli tuhat enemmän, kuin Kiinassa on jäljellä aktiivisia tautitapauksia - yhteensä. Italian 793 Koronaviruksen aiheuttamaa kuolemaa yhden päivän aikana on surullinen ennätys, mutta tämän hetkisen tiedon valossa sekin rikotaan pian. Normaalisti tällaisen tragedian ollessa kyseessä tiedotusvälineet olisivat täynnä uutisia avun lähettämisestä Italialaisille, mutta nyt ne loistavat poissaolollaan kaikkien yrittäessä valmistautua pahimpaan omissa kotimaissaan.

USA:ssa luvut muuttuvat moneen kertaan päivän aikana tietojen ripotellessa eri osavaltioista. Maassa on raportoitu eilisestä aamusta lähtien ennätykselliset 7336 uutta tartuntaa. Samalla USA hyppäsi tartuntatilastoissa kolme sijaa. Väkilukuun suhteutettuna tartuntojen määrä ei ole vielä iso, sillä Yhdysvalloissa on yli kuusi kertaa enemmän ihmisiä, kuin Italiassa.
Testausmäärät ovat kivunneet korkeiksi, joten pieni tasaantuminen kasvuluvuissa on mahdollista. Mentaliteetti USA:ssa tällaisina hetkinä on ainutlaatuinen. Normaalisti kaikenlaiseen kilpailuun viritetty yhteiskunta aloittaa kilpailun siitä, kuka osallistuu näyttävimmin vaikkapa hengityskoneiden valmistukseen. Lopputulos jää nähtäväksi, mutta periksi USA:ssa ei anneta. Inderes Forumin New Yorkin kirjeenvaihtaja kertoi illalla ihmisten viettävän lockdown-tilan vuoksi virtual happy hour -kokoontumisia. Hätä keinot keksii.

Lukujen valossa Saksassa (2516) ja Ranskassa (1847) oli tartuntojen suhteen hieman rauhallisempi vuorokausi. Espanjassa (3925) tilanne jatkuu sen sijaan nousevin tartuntaluvuin. Espanjassa, kuten Etelä-Euroopassa yleisesti, on hyvin samankaltainen perhekulttuuri, kuin Italiassa. Perheen vanhimmista huolehditaan usein perhepiirissä, mikä on hienoa, mutta saattaa olla hyvä uutinen myös virukselle.

Etelä-Koreasta ja Kiinasta ei kuulu uutta. Taudin kanssa eletään, mutta se on kontrollissa. Suomessa Uudenmaan tilanne huononee päivä päivältä eikä lisärajoituksia esim. liikkumiseen ole suljettu pois. Tauti etenee testattujen tapausten valossa vielä verkkaisesti, mutta erityisesti tartuntojen raportoidut olosuhteet antavat vihiä siitä, että niitä on tulossa vielä rutkasti lisää testausmäärien kasvaessa.

Visualisointeja, käppyröitä ja uutisia:
Johns Hopkins University , Worldometers , Reuters1 , Reuters2 , COVID tracker , TheWuhanvirus.com , WHO1 , WHO2 , BNO News , New York City tracker (new!)

In_Der_Esche · Maaliskuu 22, 2020, 6.06am

Uusien tartuntojen määrä Italiassa kasvaa edelleen nopeasti. 10 000 uuden tartunnan päivävauhti on näköpiirissä, jos rajoitteet eivät kohta pure. Seuraavaksi pala pöytälaatikkomatikkaa tosi karkeilla oletuksilla ja pyöristetyillä luvuilla.

Jos lieväoireiset eivät kuulu testattuihin (oletus 20-30x testattujen määrästä, käytän lukua 20x), on koronaviruksen saanut nyt Italiassa 1-1,5 miljoonaa ihmistä. 10 000 uuden vahvistetun tapauksen/päivä-leviämistahdilla Italiassa olisi koronaviruksen saanut ensi viikon aikana 1,4 miljoonaa ihmistä. (10 000 x 20 x 7 = 1,4 miljoonaa). Tämän päivän lukuihin yhdistettynä n. 2,5 miljoonaa tartuntaa.

Koska suurin osa tapauksista on Pohjois-Italiassa, on siellä suhteellinen sairastuvuus paljon eteläosaa korkeampi. Kahdessa viikossa samalla tartuntatahdilla jo 10% Pohjois-Italian väestöstä olisi saanut koronaviruksen! (Oletus: puolet Italian koronatapauksista olisi Pohjois-Italiassa.)

Kuten sanottu, laskenta on hyvin karkea, mutta antaa kuvan, kuinka nopeasti Pohjois-Italia lähestyy tilannetta, jossa viruksen eteneminen kohta hidastuu luonnollisista syistä. Niin moni on jo sairastanut taudin.

Jarnis · Maaliskuu 22, 2020, 6.30am

Juuri tämän “tilanne on niin paha että se on kohta hyvä”-faktorin vuoksi jos/kun Italian tilanne alkaa helpottaa, sen suora soveltaminen muiden maiden ennustamiseen on otettava varovasti. Tosin 10% on vielä kaukana siitä että laumaimmuniteetti selvästi hyydyttäisi leviämistä joka taas antaa uskoa että jos eksponentiaalinen käppyrä alkaa talttumaan nopeasti, kyse olisi sittenkin rajoitteiden puremisesta.

polo6 · Maaliskuu 22, 2020, 6.50am

Kävin eilen Terveystalolla ihotautilääkärillä, muutaman kerran vuosikymmenessä luomet tarkastutan.

(Jäädytti parit rasvaluomet nestemäisellä typellä, ei ongelmia.)

Tämä lääkäri on päivätyössä eräässä yliopistollisessa sairaalassa, ja kun juteltiin (ei ollut kiire hällä, tainnut suurin osa perua aikansa), kertoi että tulevana maanantaina komennettu ko. sairaalassa hänetkin päivystykseen korona-koulutukseen. Suunnilleen sanasta sanaan kommenttinssa: “On oltava piru merrassa että ihotautilääkäriä aletaan kouluttamaan päivystykseen.”

Invictus · Maaliskuu 22, 2020, 7.05am

Tämä osui silmääni eilen. Aika huomattava aika ollut reagoida Kiinalla uuden epidemian riskiin, jos CCP olisi niin halunnut. Oikeastaan huvittavaa, että tehokkain lääke tähänkin olisi ollut pysyvästi kieltää ja valvoa näitä eksoottisen eläinmyynnin toreja. Kyllä “kulttuurilla” on nyt hintansa.

In_Der_Esche · Maaliskuu 22, 2020, 7.34am

Tässä päästään testaamattomuuden ongelman ytimeen - valtiot joutuvat toimimaan sumussa, kun ei ole tietoa missä vaiheessa tartuntakurvia ollaan. Osa hyödyistä menee taatusti rajoitusten piikkiin, mutta joukkosuojan asteittaisen nousun vaikutus jää hämärään.

Emme tiedä onko vähäoireisten/oireettomien kerroin 20x. Onko se vakio kaikissa maissa vai onko kerroin esim. kulttuurillisista syistä jopa 50x? Vai levisikö tauti sairaaloissa, jolloin laumasuoja on alempi, mutta kuolleisuus nousi nopeasti? Mitkä ikäyhmät ovat jo koronan erityisesti sairastaneet? Paljon kysymyksiä…

Lisäys: Italiassa oli ilmeisesti tavallista vakavampi influenssakausi, joten se voi selittää vanhemman väen runsaat kuolemat. Joita Italia ja influenssa kiinnostaa, niin tutkimus Italian influenssan ja kuolemien vaihtelusta 2013-2017 ohessa:

https://www.ijidonline.com/article/S1201-9712(19)30328-5/fulltext

AnttiM · Maaliskuu 22, 2020, 7.42am

Nää tuntuvat olevan aika yleisiä näinä päivinä - oma alumniporukka (jäseniä lähes jokaisesta Euroopan maasta) on järkännyt näitä nyt noin joka toinen ilta parin viikon ajan. Mukava rupatella eri maiden suhtautumisesta kriisiin ja purkaa karanteenien aiheuttamaa ahdistusta.

Ilmeisesti New Yorkin osavaltiossa on testattu (eilisen tiedon mukaan) 45k ihmistä, Californiassa 23k ja Washingtonissa samat 23k. Eilisiltaisten tartuntamäärien (11k, 1,6k ja 1,4k) mukaan laskeskelin, että Californian ja Washingtonin testatuista n. 6-8% on ollut positiivisia, kun taas New Yorkissa sama suhdeluku oli n. 25%. Suomessa vastaava prosentti oli eilen illalla (kymppiuutisten mukaan) n. 7% (500 tartuntaa ja 7000 testiä).

New York näyttäisi siis olevan varsinainen “viruslinko” tällä hetkellä - siellähän on korkeampi väestöntiheys kuin esim. Washingtonissa ja Suomessa, sekä viileämpi ilmasto kuin Californiassa. Tämän perusteella ei näytä hyvältä Lontoon, Berliinin, Amsterdamin, Moskovan ja muiden pohjoisempien suurkaupunkien kannalta…