En ole varma, onko tätä jo saitilla jaettu, mutta itse ei ole osunut silmiin.
Näkee erittäin selkeästi paljon eri dataa epidemian leviämiseen liittyen.
Tässä Suomi: COVID-19
Ylhäältä pudotusvalikosta saa valittua eri maita. Voi verrata esim. Suomea ja Ruotsia.
Italia ja Espanja olivat karuja tapauksia.
Ja juuri nyt tuohon E-Amerikkaan liittyen esim. Brasilia näyttää aika mielenkiintoiselle. Mm. laajan epävarmuuden takia.
Suomesta taas varovaisen positiivisia uutisia: 51 uutta tartuntaa ja 6811 tutkittua näytettä. Positiivisten osuus siis vain 0,75%.
Todella hyvä 
testienkin määrä aika kova. Nyt alkaa touhu näyttämään paremmalta.
Näin on. Olen koettanut tuoda julki, että kyseessä on vakava monielinsairaus…
En tiedä, mistä olen kirjanmerkkeihin tuon sivun laittanut, onko joskus täältä vai muualta. Näyttää joka tapauksessa edelleen päivittyvän. Eli vasta-ainetestit kootusti täällä nähtävillä.
Tanskassa koulut ovat olleet auki kuukauden, eikä se ole juurikaan lisännyt tartuntoja.
Aamun luvut (tartunnat/kuolleet): 4,43M / 298174
Vuorokauden aikana uusien tartuntojen(+88200) määrä oli pienessä nousussa ja kuolemantapausten määrä(+5300) pysyi ennallaan. Tautitilanne jatkaa paranemistaan Euroopassa Venäjää lukuun ottamatta. Pahin tautitilanne on Etelä-Amerikassa ja Venäjällä. Todellinen ruutitynnyri kytee edelleen Intiassa ja Pakistanissa, missä on potentiaalia isolle virustuholle.
Yhdysvalloissa virustilanne on pysynyt alkuviikon vakaana. Maan viruspäälliköksi tituleerattu Dr. Anthony Fauci kertoi mielipiteitään eilen Senaatille. Presidentti Trump ennätti kuulemisen jälkeen kertomaan olevansa tyytymätön Faucin sanomisiin. Erityisesti kuulemisessa hiersi Faucin mielipide siitä, että kouluja ei pitäisi vielä avata. Päivän presidentillinen anti jäi laihaksi. Uutisiin ylsi jopa presidentin vastavuoroinen kommentti “etäisyyden pitämisestä” varapresidentti Penceen.
Viruksen ansiosta USA:ssa tehdään päivittäin poikkeuksellisia ennätyksiä. Vähentyneen liikenteen ansiosta New Yorkin kaupungin liikenteessä ei ole kuollut yhtäkään jalankulkijaa lähes kahteen kuukauteen. Se on vähiten koko 37 vuoden tilastoinnin aikana. New Yorkin kaupungin liikkuminen on muutenkin murroksessa. Kaupungissa suljetaan tänään lähes 12 mailia teitä autoilulta edellisten sulkujen lisäksi. Teitä muutetaan pyöräilykaistoiksi ja kävelyteiksi. Erityisesti työmatkapyöräily on lisääntynyt kaupungissa huomattavasti.
Presidentti Trumpin USA ei ole tunnettu ympäristöteoistaan. Väistämätöntä kehitystä ei yhden presidenttikauden aikana voi kuitenkaan pysäyttää. Siitä antoi muistutuksen eilen uutisoitu tieto USA:n energiatuotannosta. Pandemian ansiosta uusiutuvan energian tuotanto ylittää ensimmäistä kertaa historian aikana hiilellä tuotetun energian määrän tämän vuoden aikana.
Saksan tartunnat olivat vuorokauden aikana nousussa, mutta jäivät silti alle tuhannen. Saksa ehti jo eilen pudota tartuntojen määrässä yhden päivän ajaksi Ruotsin tartuntamäärien alapuolelle. Tilannetta Saksassa seurataan tiiviisti ja maan hallitus on kertonut korjaavansa suuntaa, jos siihen on aihetta.
Turismista riippuvaisille Etelä-Euroopan maille tuleva kesä näyttää murskaavalta. Espanjassa on suunniteltu kuumeisesti, miten pahimmalta romahdukselta vältytään. Maassa on yritetty kehittää erilaisia ehdotuksia mm. Euroopan “vihreistä alueista”, joiden välillä matkustaminen olisi sallittua. Asiasta uutisoi Euronews.
Etelä-Amerikan tilanne huononee edelleen. Brasiliassa uusia tartuntoja(+11555) tilastoitiin toiseksi eniten maailmassa, mutta myös pienemmissä Chilessä(+2660) ja Perussa(+4247) tilanne on huono. Brasiliassa tilanne kaikkinensa on hyvin sekava, sillä viruskriisin lisäksi maassa muhii jälleen kerran myös korruptioskandaali. Epäiltynä on maan presidentti Jair Bolsonaro.
Aasiassa Intian(+3763) ja Pakistanin(+2624) tartuntatilanne on huono, mutta ei ole pahentunut merkittävästi viikon aikana. Kiinassa todettiin tänään ainoastaan kolme uutta tartuntaa ja Etelä-Korea on saanut pidettyä taudin yökerhoryppään aisoissa. Uusia tartuntoja tilastoitiin Etelä-Koreassa tänään 29.
Suomessa on herännyt keskustelua rajoitusten laajuudesta esim. ravintoloiden osalta. Noin 40% maan sairaanhoitopiireistä on ollut ilman tartuntoja jo pitkään, joten Uusimaa-painotteisten tartuntojen pohjalta tehdyt rajoitukset eivät näytä järkeviltä. Tartuntatilanne Suomessa näyttää helpottavan lisääntyneestä ja laajentuneesta testauksesta huolimatta.
Visualisointeja, käppyröitä ja uutisia:
Johns Hopkins , Worldometers , Reuters1 , Reuters2 , COVID tracker , TheBaselab , WHO1 , WHO2 , NYC tracker , COVID daily USA , THL kartta , FHM kartta (Ruotsi) , Bloomberg , rt.live (USA state tracking) , EndCoronavirus
Toivottavasti Suomessa pysyy hanskassa eikä tänne kanneta uusia ryppäitä ulkoa. Ruotsi ja Venäjä molemmat potentiaalisia lähteitä…
100% tarkkuus on aika paljon. Olisiko tämä omalta osaltaan game changer?
PHE, which conducted an independent evaluation of Roche’s antibody test last week, said it found Roche’s assay has a specificity of 100%.
“This is a very positive development because such a highly specific anti-body test is a very reliable marker of past infection,” UK’s coronavirus testing programme coordinator John Newton said.
Saa nähdä miten meille käy täällä Ahvenanmaalla, kun ruotsalaisia rupeaa taas valumaan tänne. Työmatkailu ja mökkeilyreissut siis sallitaan Ruotsin ja Ahvenanmaan välillä tästä päivästä lähtien.
Tuskin sentään ihan game changer. Se ei mihinkään muutu, että verinäytteessä ei välttämättä ole vasta-aineita havaittavaksi vaikka tauti olisikin päällä/ohi. Tämmöisen ison luotettavan valmistajan testi on kyllä laadullisesti ihan eri luokkaa kuin monen muun firman nopeasti kyhätyt pikatestit jotka testattiin pienellä potilasnäytemäärillä. Aikaa kului ison talon kehityksessä, mutta nyt lupaavat 99,8% spesifisyyden ja 100% sensitiivisyyden (yli 5000 näytteellä varmistettu) eli vääriä tuloksia ei itse analyysistä juuri ole tulossa. Erinomainen valinta jos sopiva analysaattori talosta löytyy…
Ranskassa näyttäisi maan tasolla olevan vasta-aineita 4,4% väestöstä.
Espanjassa vastaava luku 5% ja pahiten kärsineessä Madridissa 11%.
En ehtinyt tarkemmin perehtyä aiheeseen tai tutkia lähteitä, mutta eiköhän näistä uutisoida lisää jos pitävät paikkansa.
Ei lupaa hyvää Ruotsille - eikä liioin meille kellekään. Näyttäisi, että rokote ainut tie ulos koronasta. Tai muuten tulee tosi pitkä tie talsittavaksi.
Joo, kyllä viruksen kanssa tulee elää aika pitkään. Suomessa maskit yhtenä keinona on tähän mennessä tyrmätty.
Ilahduttavasti lopultakin järjen ääntä tähän asiaan. Siihen näemmä tarvittiin entinen Valtion Teknillinen Tutkimuskeskus.
Esimerkiksi rautakaupoissa myytävänä oleviin pölysuodatinmaskeihin verrattuna hiukkasannos on monikymmenkertainen. Pölysuodatin voi parhaimmillaan suodattaa jopa 80 prosenttia sisäilman hiukkasista.
– Mutta annos, mikä me levitetään itsestämme ulospäin, on aika lailla samanlainen oli meillä sitten kangasmaski tai venttiilillä varustettu pölysuojain, selittää Harlin.
Tutkijan mukaan Suomessa maskikeskustelu on juuttunut ajatukseen, kuinka me voimme suojata itseämme.
– Esimerkiksi Singaporessa ja Japanissa, jossa maskit on hyvin aikaisessa vaiheessa otettu käyttöön, on perinteisesti ollut kyse siitä, että suojataan yhteisöä ja kanssaihmisiä Se on 180 astetta erilainen ajattelumaailma kuin täällä.
Specificity ei ole sama asia kuin tarkkuus (accuracy).
Otin vapauden kuvata näitä kahta yhdellä sanalla “tarkkuus”, mikä mielestäni kuvaa asiaa kaltaisteni tavisten ymmärtämällä kielellä hyvin. Tilastomatemaatikoille ja biotieteilijöille yksinkertaistus saattaa särähtää korvaan. 
Kysehän on siis siitä, että näytteistä on onnistuttu tunnistamaan negatiiviset ja positiiviset näytteet. Eli tarkkoja ovat.
Sensitivity and specificity are statistical measures of the performance of a binary classification test, also known in statistics as a classification function, that are widely used in medicine:
- Sensitivity (also called the true positive rate , the recall , or probability of detection [1] in some fields) measures the proportion of actual positives that are correctly identified as such (e.g., the percentage of sick people who are correctly identified as having the condition).
- Specificity (also called the true negative rate ) measures the proportion of actual negatives that are correctly identified as such (e.g., the percentage of healthy people who are correctly identified as not having the condition).
Kyseisessä artikkelissa ei taideta puhua sensitiivisyydestä tai tarkkuudesta lainkaan? Kenties jossain muussa artikkelissa todettu myös sensitiivisyyden olevan kohdallaan?
Jos oikein muistan tilastotieteen peruskurssilta, mittalaitteella, joka palauttaa aina FALSEn, spesifisyys on 100 %, mutta tämmöisellä mittalaitteella ei tee yhtään mitään, jollei sensitiivisyys ole kohdallaan (eli osaisi poimia myös tautitapauksia). Toisin sanoen, tietämättä muita parametreja, tuo mittarihan saattaa sylkeä false negativejä ulos kovaan tahtiin, ja on siten täysin käyttökelvoton.
Olettaisin, että tämmöisissä tautitestereissä liiallinen sensitiivisyys olisi parempi vaihtoehto (liikaa koronailmoituksia) kuin se, että negatiivisen tuloksen saaneet taudin kantajat levittävät tautia ympäriinsä. Vrt. parempi saada terveenä false positive syöpätestistä ja kokea hetkellinen järkytys kuin syöpäpotilaana saada false negative, ja luulla olevansa terve, vaikka todellisuudessa olisi tarvetta pikaiselle hoidolle.
Mediakin taisi juuri eilen uutisoida, että Valkoisen talon testerin sensitiivisyys olisi 50 % luokkaa.
Myös Fortune uutisoi:
The analysis, which has yet to be confirmed, found that Abbott’s ID NOW missed at least one-third of positive cases detected with a rival test and as much as 48% when using the currently recommended dry nasal swabs
Kannattaa siis olla tosi varovainen yleistysten kanssa.
Ongelmahan on nimenomaan ollut väärät negatiiviset, joten ymmärrän kyllä hyvin median hehkutuksen.
Tämä ei ole yleistys. Valmistajan omista tuotetiedosta näkyy 99,8% spesifisyys ja 100% sensitiivisyys. Lähes kaikki tulokset ovat siten ‘oikeita’ ainakin analyyttisen menetelmän osalta.